Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx1P81068 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx1P81068 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms