Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Otx2P80206 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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