Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms