Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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