Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vbp1P61759 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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