Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms