Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms