Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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