Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GferP56213 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GferP56213 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GferP56213 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GferP56213 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms