Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SqleP52019 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SqleP52019 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SqleP52019 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SqleP52019 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SqleP52019 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SqleP52019 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms