Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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