Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms