Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cav1P49817 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms