Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pik3caP42337 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pik3caP42337 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pik3caP42337 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pik3caP42337 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pik3caP42337 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pik3caP42337 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pik3caP42337 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pik3caP42337 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms