Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sept2P42208 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms