Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tnfsf9P41274 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tnfsf9P41274 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms