Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms