Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms