Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin1P35438 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin1P35438 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms