Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpardP35396 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpardP35396 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms