Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms