Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh15P33146 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms