Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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