Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms