Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cd28P31041 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cd28P31041 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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