Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms