Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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RxrgP28705 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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RxrgP28705 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RxrgP28705 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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RxrgP28705 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxrgP28705 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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