Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gjc1P28229 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms