Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd247P24161 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd247P24161 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd247P24161 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.6 ms