Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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