Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkchP23298 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkchP23298 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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