Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms