Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpcP21841 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms