Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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