Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TP20293 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TP20293 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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