Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms