Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18530 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18530 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18530 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms