Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nr4a1P12813 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms