Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms