Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DmdP11531 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DmdP11531 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DmdP11531 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DmdP11531 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DmdP11531 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DmdP11531 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.2 ms