Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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