Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tgfb1P04202 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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