Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3dO70194 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3dO70194 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3dO70194 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3dO70194 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3dO70194 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3dO70194 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eif3dO70194 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms