Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms