Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffaO54786 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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DffaO54786 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffaO54786 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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DffaO54786 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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DffaO54786 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DffaO54786 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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