Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms