Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg3O35902 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg3O35902 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms