Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms