Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ArxO35085 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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