Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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